Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtpreP49446 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PtpreP49446 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PtpreP49446 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PtpreP49446 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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PtpreP49446 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtpreP49446 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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