Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11bP46638 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms