Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PparaP23204 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PparaP23204 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms