Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Prrt1O35449 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Prrt1O35449 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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