Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
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Gm20795J3QP49 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Gm20795J3QP49 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Gm20795J3QP49 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
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Gm20795J3QP49 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Gm20795J3QP49 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Gm20795J3QP49 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
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Gm20795J3QP49 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Gm20795J3QP49 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
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