Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I0

Letm1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm1Q9Z2I0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Letm1Q9Z2I0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Letm1Q9Z2I0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Letm1Q9Z2I0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms