Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rlbp1Q9Z275 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rlbp1Q9Z275 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rlbp1Q9Z275 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.2 ms