Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1h3Q9Z0Y9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nr1h3Q9Z0Y9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1h3Q9Z0Y9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1h3Q9Z0Y9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1h3Q9Z0Y9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1h3Q9Z0Y9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nr1h3Q9Z0Y9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nr1h3Q9Z0Y9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nr1h3Q9Z0Y9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms