Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R6

Itsn2, Intersectin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn2Q9Z0R6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Itsn2Q9Z0R6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Itsn2Q9Z0R6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Itsn2Q9Z0R6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Itsn2Q9Z0R6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Itsn2Q9Z0R6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Itsn2Q9Z0R6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Itsn2Q9Z0R6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Itsn2Q9Z0R6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Itsn2Q9Z0R6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms