Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp2Q9Z0E6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp2Q9Z0E6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms