Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG9

Msl3, Male-specific lethal 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3Q9WVG9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Msl3Q9WVG9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Msl3Q9WVG9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms