Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim10Q9WUH5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim10Q9WUH5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim10Q9WUH5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim10Q9WUH5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim10Q9WUH5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim10Q9WUH5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim10Q9WUH5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim10Q9WUH5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
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