Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pfdn5Q9WU28 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pfdn5Q9WU28 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.6 ms