Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1X5

Abcc5, Multidrug resistance-associated protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc5Q9R1X5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Abcc5Q9R1X5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Abcc5Q9R1X5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Abcc5Q9R1X5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Abcc5Q9R1X5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Abcc5Q9R1X5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Abcc5Q9R1X5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms