Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Psmb3Q9R1P1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms