Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf4Q9QZS2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf4Q9QZS2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf4Q9QZS2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf4Q9QZS2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf4Q9QZS2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf4Q9QZS2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf4Q9QZS2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms