Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Npas3Q9QZQ0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Npas3Q9QZQ0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms