Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp21Q9QZL6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp21Q9QZL6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp21Q9QZL6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms