Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mid2Q9QUS6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mid2Q9QUS6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mid2Q9QUS6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms