Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rabgef1Q9JM13 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Rabgef1Q9JM13 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rabgef1Q9JM13 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rabgef1Q9JM13 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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