Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nectin3Q9JLB9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Nectin3Q9JLB9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms