Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Bace2Q9JL18 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bace2Q9JL18 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bace2Q9JL18 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.7 ms