Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rcan3Q9JKK0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rcan3Q9JKK0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rcan3Q9JKK0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rcan3Q9JKK0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rcan3Q9JKK0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rcan3Q9JKK0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rcan3Q9JKK0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rcan3Q9JKK0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rcan3Q9JKK0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rcan3Q9JKK0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rcan3Q9JKK0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rcan3Q9JKK0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rcan3Q9JKK0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rcan3Q9JKK0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rcan3Q9JKK0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rcan3Q9JKK0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rcan3Q9JKK0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms