Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcnq4Q9JK97 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Kcnq4Q9JK97 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kcnq4Q9JK97 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms