Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cngb3Q9JJZ9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cngb3Q9JJZ9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cngb3Q9JJZ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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