Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc86Q9JJ89 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc86Q9JJ89 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc86Q9JJ89 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms