Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESL0

Oxct2b, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2B, mitochondrial, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2bQ9ESL0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Oxct2bQ9ESL0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Oxct2bQ9ESL0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms