Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cse1lQ9ERK4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cse1lQ9ERK4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cse1lQ9ERK4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms