Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tspan4Q9DCK3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tspan4Q9DCK3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tspan4Q9DCK3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms