Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB76

Emc9, ER membrane protein complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc9Q9DB76 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emc9Q9DB76 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Emc9Q9DB76 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Emc9Q9DB76 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emc9Q9DB76 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emc9Q9DB76 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emc9Q9DB76 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emc9Q9DB76 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emc9Q9DB76 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emc9Q9DB76 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emc9Q9DB76 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Emc9Q9DB76 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emc9Q9DB76 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emc9Q9DB76 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emc9Q9DB76 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emc9Q9DB76 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emc9Q9DB76 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emc9Q9DB76 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Emc9Q9DB76 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Emc9Q9DB76 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms