Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn34b2Q9D9N2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn34b2Q9D9N2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn34b2Q9D9N2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn34b2Q9D9N2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn34b2Q9D9N2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn34b2Q9D9N2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn34b2Q9D9N2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn34b2Q9D9N2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn34b2Q9D9N2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn34b2Q9D9N2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn34b2Q9D9N2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn34b2Q9D9N2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn34b2Q9D9N2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34b2Q9D9N2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms