Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx5Q9D8U8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx5Q9D8U8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Snx5Q9D8U8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms