Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gtf3c6Q9D8P7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gtf3c6Q9D8P7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf3c6Q9D8P7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms