Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Derl3Q9D8K3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Derl3Q9D8K3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms