Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Slc52a2Q9D8F3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slc52a2Q9D8F3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc52a2Q9D8F3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms