Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Jam3Q9D8B7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Jam3Q9D8B7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Jam3Q9D8B7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms