Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn22Q9D7U6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms