Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
2310002L09RikQ9D7L5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
2310002L09RikQ9D7L5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
2310002L09RikQ9D7L5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms