Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpap3Q9D706 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpap3Q9D706 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms