Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gbe1Q9D6Y9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gbe1Q9D6Y9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms