Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pfn4Q9D6I3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pfn4Q9D6I3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms