Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc81Q9D5W4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc81Q9D5W4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc81Q9D5W4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms