Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E4

Drc3, Dynein regulatory complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Drc3Q9D5E4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Drc3Q9D5E4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Drc3Q9D5E4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Drc3Q9D5E4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Drc3Q9D5E4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms