Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3404Q9D506 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3404Q9D506 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3404Q9D506 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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