Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
4931428L18RikQ9D4S9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms