Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4930578G10RikQ9D4Q4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
4930578G10RikQ9D4Q4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930578G10RikQ9D4Q4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
4930578G10RikQ9D4Q4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms