Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W5

Lrrc71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc71Q9D3W5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc71Q9D3W5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc71Q9D3W5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc71Q9D3W5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms