Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Obox1Q9D350 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Obox1Q9D350 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms