Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmed11Q9D2R4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed11Q9D2R4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed11Q9D2R4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed11Q9D2R4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmed11Q9D2R4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed11Q9D2R4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed11Q9D2R4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed11Q9D2R4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed11Q9D2R4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed11Q9D2R4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmed11Q9D2R4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmed11Q9D2R4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmed11Q9D2R4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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