Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trmt44Q9D2Q2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt44Q9D2Q2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt44Q9D2Q2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms